【招标公告】内蒙古综合疾控中心鼠疫防控科菌株测序公开招标公告

内蒙古自治区综合疾病预防控制中心鼠疫防控科鼠疫菌株测序 公开招标公告 根据内蒙古自治区综合疾病预防控制中心采购实施办法,现公开招标鼠疫菌株测序,欢 迎符合条件的供应商前来报名参加。 一、项目名称:鼠疫菌株测序 二、预算金额:贰万伍仟元整(***) 三、项目技术参数及具体要求 鼠疫菌株,数量10株。 具体要求如下: 1、测序平台 要求供应商采用三代 Pacbio 和二代 illumina 高通量测序平台进行测序。 2、生物信息学分析: 2.1 样品组装:要求选择最优的参数组装筛选获得基因组的最初的基因组组装结果,采 用krskgf、gapclose 等软件对初步组装结果进行优化和补洞,从而得到最终的组装结果。 2.2 重复序列搜寻:要求能使用多种软件对组装序列进行重复序列预测,如 RepeatMasker,TRF 等,重复序列的类型应包括散在重复序列、串联重复序列。 2.3 基于序列组成,要求采用 IslandPath-DIOMB 软件预测基因岛,其通过检测序列中 二核苷酸偏向性和移动性基因以判定基因岛以及潜在的水平基因转移。 2.4 功能分析:要求对预测的基因进行功能注释,比对的数据库数≥6个,应涵盖GO、 KEGG、COG、NR、Pfam、Card。 3.供应商应具备但不限于以下高级分析能力。 3.1 cgmlst 分析 3.2 GWAS 关联分析 3.3 比较基因组分析 3.4 群体进化分析 4.项目周期: 每批样本的测序周期从建库成功开始,内完成所有测序、数据处理工作及提供结题所需 时间≤60个工作日。 5.项目结题时,供应商应提供结题报告和原始数据。 四、报价及报价函要求 1.投标报名人须提供经国家工商机关年检合格有效并加盖投标企业公章的营业执照(营 业执照经营范围须包含公开招采内容)复印件、经企业法人签字并加盖公章的”授权委托书" 及被委托人的身份证复印件(上述证件不密封,附外以便审核) 2.投标报价须报出单价及总价,报价函须加盖企业公章后密封签字、盖章递交,封面标 注投标项目名称、企业名称、企业联系人及联系方式。 3.投标报价须在有效期投标,报价包含所有税费。 4.中心设备与试剂科负责资格初审,最终资格由中心采购小组认定。 五、投标报名时间地点及要求 1、时间:2021年11月23日-11月25日 2、投标报名地点:内蒙古自治区综合疾病预防控制中心鸿盛工业园区综合楼三楼 306 3、投标报名联系人:董冰 联系电话:0471-4395884 内蒙占自冶区综合疾病预防控制中心 年 z2